肿瘤新生抗原预测

背景说明
肿瘤新抗原:新生抗原是由肿瘤中的体细胞突变等来源产生的能诱导肿瘤特异性T细胞识别的多肽,是一种肿瘤特异性抗原。它们可以被免疫系统识别,并激发免疫应答,从而靶向杀伤肿瘤细胞。
分析流程
外显子与RNA测序,结合质谱检测的分析平台以及配套生物信息软件,快速准确地鉴定肿瘤新生抗原。
外显子与RNA测序,结合质谱检测的分析平台以及配套生物信息软件,快速准确地鉴定肿瘤新生抗原。
分析项目
原始数据质控与过滤
比对质控
转录本定量
突变检测与注释
肿瘤异质性评估
HLA杂合性缺失(LOH)
MHC-I亲和力预测
MHC-II亲和力预测
肽免疫原性评估及筛选
HLA分型
融合基因分析
新生抗原在蛋白水平上表达

应用示例
Neoantigen synthesis process
基于新生抗原合成疫苗的工作流程
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